Naughty Dog ha anche omaggiato la serie di Monkey Island. All'interno di una sezione puzzle del capitolo 11, Nate trova alcuni dipinti legati a diversi sigilli, alcuni un po' bruciati, e uno di questi raffigura il temibile pirata Guybrush (che razza di nome è?) Seepgood, a cui è correlato il simbolo della scimmia. Se la somiglianza della figura con Peepwood non vi bastasse, più avanti è possibile trovare un altro quadro raffigurante il protagonista della storica serie di LucasArts, con sotto le iniziali del nome. Sono ben visibili solo le prime due lettere iniziali "Gu" mentre il resto è cancellato, ma si vede chiaramente anche una "W". C'è poi anche un'altra citazione inerente alla famosa avventura grafica, in cui Drake dice: "È la seconda più grande cisterna che abbia mai visto". Vi ricorda qualcosa?