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Anche la serie Duke Nukem si deve ad Apogee, e anche in questo caso il modello scelto fu lo shareware. Il primo gioco uscì nel 1991, e già da allora i giocatori impersonavano il famoso Duca, contro le macchinazioni del perfido e folle Dr. Proton. Duke deve farsi strada combattendo tra le rovine di una futuristica (cioè del 1997) Los Angeles, e in una base segreta del futuro per fermare l'esercito robotico del Dr. Proton.
Naturalmente la storia è sostanzialmente inesistente, né si può parlare di personalità per questa prima versione di Duke Nukem. Il protagonista è il solito personaggio da gioco d'azione. Solo con Duke Nukem 3D sarebbe arrivato l'umorismo. In ogni caso il gioco è divertente, anche oggi dopo oltre vent'anni dalla prima pubblicazione.